Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms