Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms