Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms