Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TK1P04183 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TK1P04183 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms