Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
WDR53Q7Z5U6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms