Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms