Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
EEA1Q15075 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
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