Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM106CQ9BVX2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM106CQ9BVX2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms