Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms