Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TK1P04183 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TK1P04183 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TK1P04183 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TK1P04183 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TK1P04183 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TK1P04183 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms