Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRYD3Q8NCJ5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms