Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms