Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms