Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARID3CA6NKF2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3CA6NKF2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms