Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMCO3A2RU48 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO3A2RU48 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms