Protein–RNA interactions for Protein: Q9P287

BCCIP, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCCIPQ9P287 CD164-203ENST00000324953 2936 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.692e-10■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CD164-201ENST00000275080 2954 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.782e-10■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 25e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CPNE1-216ENST00000437340 1755 ntTSL 1 (best)26.89■■□□□ 1.95e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.855e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CPNE1-205ENST00000401607 1795 ntTSL 526.32■■□□□ 1.85e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CPNE1-207ENST00000414664 1070 ntTSL 526.09■■□□□ 1.775e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 RBM12-204ENST00000424458 1068 ntTSL 226.09■■□□□ 1.775e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CPNE1-212ENST00000430570 1332 ntTSL 525.64■■□□□ 1.75e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CPNE1-217ENST00000439669 784 ntTSL 524.96■■□□□ 1.595e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CPNE1-223ENST00000475146 627 ntTSL 324.96■■□□□ 1.595e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CPNE1-220ENST00000458038 596 ntTSL 322.81■■□□□ 1.245e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CPNE1-211ENST00000420363 821 ntTSL 222.07■■□□□ 1.125e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CPNE1-219ENST00000440240 746 ntTSL 521.92■■□□□ 1.15e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CPNE1-204ENST00000397443 1928 ntAPPRIS P1 TSL 521.23■□□□□ 0.995e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CPNE1-210ENST00000416778 744 ntTSL 218.68■□□□□ 0.585e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CPNE1-213ENST00000434795 831 ntTSL 318.68■□□□□ 0.585e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CPNE1-224ENST00000483359 1975 ntTSL 518.13■□□□□ 0.495e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.445e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.365e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CPNE1-208ENST00000414711 673 ntTSL 517.18■□□□□ 0.345e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CPNE1-215ENST00000437100 826 ntTSL 514.97□□□□□ -0.015e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CPNE1-206ENST00000412056 998 ntTSL 314.26□□□□□ -0.135e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.165e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 RBM12-206ENST00000435161 565 ntTSL 412.15□□□□□ -0.465e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 RBM12-205ENST00000431148 583 ntTSL 411.81□□□□□ -0.525e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 CPNE1-218ENST00000439806 748 ntTSL 511.11□□□□□ -0.635e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.635e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 AL109827.1-202ENST00000441563 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.36□□□□□ -0.755e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 AL109827.1-201ENST00000454607 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.36□□□□□ -0.755e-7■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 DLGAP4-AS1-201ENST00000425233 443 ntTSL 516.26■□□□□ 0.194e-6■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.254e-6■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 DLGAP4-AS1-204ENST00000559455 584 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.74e-6■■■□□ 17.8
BCCIPQ9P287 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.92e-6■■■□□ 17.5
BCCIPQ9P287 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.762e-6■■■□□ 17.5
BCCIPQ9P287 CTAGE5-216ENST00000556990 568 ntTSL 415.03■□□□□ -04e-7■■■□□ 17.4
BCCIPQ9P287 CTAGE5-202ENST00000280083 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.224e-7■■■□□ 17.4
BCCIPQ9P287 CTAGE5-206ENST00000396158 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.334e-7■■■□□ 17.4
BCCIPQ9P287 CTAGE5-214ENST00000556148 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.624e-7■■■□□ 17.4
BCCIPQ9P287 CTAGE5-205ENST00000348007 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.824e-7■■■□□ 17.4
BCCIPQ9P287 CTAGE5-213ENST00000555716 558 ntTSL 47.04□□□□□ -1.284e-7■■■□□ 17.4
BCCIPQ9P287 CTAGE5-211ENST00000554392 527 ntTSL 46.6□□□□□ -1.354e-7■■■□□ 17.4
BCCIPQ9P287 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.444e-7■■■□□ 17.4
BCCIPQ9P287 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.464e-7■■■□□ 17.4
BCCIPQ9P287 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.464e-7■■■□□ 17.4
BCCIPQ9P287 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.484e-7■■■□□ 17.4
BCCIPQ9P287 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.524e-7■■■□□ 17.4
BCCIPQ9P287 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.251e-6■■■□□ 17.3
BCCIPQ9P287 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.581e-6■■■□□ 17
BCCIPQ9P287 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.11e-6■■■□□ 17
BCCIPQ9P287 RPS15A-201ENST00000322989 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.311e-6■■■□□ 17
BCCIPQ9P287 RPS15A-206ENST00000569083 1022 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.551e-6■■■□□ 17
BCCIPQ9P287 RPS15A-208ENST00000572008 797 ntTSL 57.59□□□□□ -1.191e-6■■■□□ 17
BCCIPQ9P287 RPS15A-212ENST00000576008 589 ntTSL 1 (best)5.84□□□□□ -1.471e-6■■■□□ 17
BCCIPQ9P287 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.491e-6■■■□□ 17
BCCIPQ9P287 RPS15A-202ENST00000562935 427 ntTSL 25.76□□□□□ -1.491e-6■■■□□ 17
BCCIPQ9P287 RPS15A-210ENST00000574723 418 ntTSL 34.9□□□□□ -1.631e-6■■■□□ 17
BCCIPQ9P287 RPS15A-207ENST00000569365 481 ntTSL 34.79□□□□□ -1.641e-6■■■□□ 17
BCCIPQ9P287 OGT-203ENST00000444774 556 ntTSL 411.1□□□□□ -0.634e-8■■■□□ 17
BCCIPQ9P287 OGT-204ENST00000455587 632 ntTSL 39.34□□□□□ -0.914e-8■■■□□ 17
BCCIPQ9P287 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.054e-8■■■□□ 17
BCCIPQ9P287 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.184e-8■■■□□ 17
BCCIPQ9P287 OGT-210ENST00000488174 7243 ntTSL 57.17□□□□□ -1.264e-8■■■□□ 17
BCCIPQ9P287 OGT-211ENST00000498566 601 ntTSL 34.91□□□□□ -1.624e-8■■■□□ 17
BCCIPQ9P287 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.475e-8■■■□□ 17
BCCIPQ9P287 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.513e-6■■■□□ 16.9
BCCIPQ9P287 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.723e-9■■■□□ 16.7
BCCIPQ9P287 TBL1X-205ENST00000422314 496 ntTSL 224.57■■□□□ 1.523e-9■■■□□ 16.7
BCCIPQ9P287 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.053e-9■■■□□ 16.7
BCCIPQ9P287 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.163e-9■■■□□ 16.7
BCCIPQ9P287 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.163e-9■■■□□ 16.7
BCCIPQ9P287 TBL1X-208ENST00000452824 387 ntTSL 511.87□□□□□ -0.513e-9■■■□□ 16.7
BCCIPQ9P287 TBL1X-204ENST00000415293 565 ntTSL 56.79□□□□□ -1.323e-9■■■□□ 16.7
BCCIPQ9P287 TBL1X-207ENST00000441088 520 ntTSL 36.79□□□□□ -1.323e-9■■■□□ 16.7
BCCIPQ9P287 MTUS1-210ENST00000518755 610 ntTSL 32.85□□□□□ -1.954e-9■■■□□ 16.7
BCCIPQ9P287 ANKRD11-210ENST00000566858 580 ntTSL 416.82■□□□□ 0.282e-6■■■□□ 16.4
BCCIPQ9P287 ANKRD11-213ENST00000567736 2750 ntTSL 216.21■□□□□ 0.192e-6■■■□□ 16.4
BCCIPQ9P287 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 515.92■□□□□ 0.142e-6■■■□□ 16.4
BCCIPQ9P287 ANKRD11-212ENST00000567699 412 ntTSL 515.87■□□□□ 0.132e-6■■■□□ 16.4
BCCIPQ9P287 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 515.12■□□□□ 0.012e-6■■■□□ 16.4
BCCIPQ9P287 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.012e-6■■■□□ 16.4
BCCIPQ9P287 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.347e-8■■■□□ 16.4
BCCIPQ9P287 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.119e-10■■■□□ 16.2
BCCIPQ9P287 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.197e-8■■■□□ 16.2
BCCIPQ9P287 SLC12A7-204ENST00000513223 1066 ntTSL 515.87■□□□□ 0.137e-8■■■□□ 16.2
BCCIPQ9P287 SLC12A7-206ENST00000634447 3142 ntTSL 515.13■□□□□ 0.017e-8■■■□□ 16.2
BCCIPQ9P287 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.155e-9■■■□□ 16.1
BCCIPQ9P287 FBXO31-204ENST00000565593 2717 ntTSL 521.89■■□□□ 1.095e-9■■■□□ 16.1
BCCIPQ9P287 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.045e-9■■■□□ 16.1
BCCIPQ9P287 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.061e-10■■■□□ 16.1
BCCIPQ9P287 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.111e-10■■■□□ 16.1
BCCIPQ9P287 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.121e-10■■■□□ 16.1
BCCIPQ9P287 NAPB-203ENST00000432543 3754 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.41e-10■■■□□ 16.1
BCCIPQ9P287 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.641e-323■■■□□ 16
BCCIPQ9P287 NCAPD2-202ENST00000382457 2844 ntTSL 512.85□□□□□ -0.351e-323■■■□□ 16
BCCIPQ9P287 NCAPD2-207ENST00000539084 4290 ntTSL 211.65□□□□□ -0.541e-323■■■□□ 16
BCCIPQ9P287 NCAPD2-208ENST00000539714 533 ntTSL 37□□□□□ -1.291e-323■■■□□ 16
BCCIPQ9P287 NCAPD2-210ENST00000541399 584 ntTSL 56.8□□□□□ -1.321e-323■■■□□ 16
BCCIPQ9P287 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.91□□□□□ -1.461e-323■■■□□ 16
BCCIPQ9P287 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.32□□□□□ -1.721e-323■■■□□ 16
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