Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWS0

PHF6, PHD finger protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF6Q8IWS0 TBCD-205ENST00000571618 775 ntTSL 313.07□□□□□ -0.324e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TBCD-206ENST00000571712 850 ntTSL 512.71□□□□□ -0.374e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TBCD-210ENST00000572953 702 ntTSL 512.57□□□□□ -0.44e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 DYRK1A-206ENST00000455097 338 ntTSL 1 (best)12.54□□□□□ -0.43e-11■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TBCD-213ENST00000574422 879 ntTSL 212.08□□□□□ -0.484e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 STK25-206ENST00000413760 801 ntTSL 312□□□□□ -0.494e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.54e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TBCD-217ENST00000574975 867 ntTSL 511.76□□□□□ -0.534e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.544e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.554e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 CHID1-210ENST00000526714 976 ntTSL 511.47□□□□□ -0.574e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TBCD-219ENST00000576160 942 ntTSL 511.47□□□□□ -0.574e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.684e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 SIN3A-210ENST00000568309 549 ntTSL 410.68□□□□□ -0.74e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.744e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 SIN3A-205ENST00000564778 617 ntTSL 210.28□□□□□ -0.764e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PKNOX1-201ENST00000291547 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.784e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 SIN3A-201ENST00000360439 5050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.824e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PKNOX1-203ENST00000432907 5180 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.834e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PFKFB4-214ENST00000490404 849 ntTSL 39.67□□□□□ -0.864e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.914e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 ZEB2-219ENST00000475115 536 ntTSL 59.38□□□□□ -0.914e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 SIN3A-211ENST00000568431 565 ntTSL 59.33□□□□□ -0.924e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 SIN3A-209ENST00000568190 567 ntTSL 48.79□□□□□ -14e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.273e-11■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.324e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 TRIB3-204ENST00000615226 877 ntTSL 36.8□□□□□ -1.324e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PFKFB4-210ENST00000468162 576 ntTSL 56.37□□□□□ -1.394e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.574e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PIP5K1C-207ENST00000636612 153 ntTSL 55.24□□□□□ -1.574e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 DYRK1A-205ENST00000426672 519 ntTSL 55.06□□□□□ -1.63e-11■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 36.3
PHF6Q8IWS0 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 416.56■□□□□ 0.242e-48■■■■■ 36.1
PHF6Q8IWS0 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.062e-48■■■■■ 36.1
PHF6Q8IWS0 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.42e-48■■■■■ 36.1
PHF6Q8IWS0 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.422e-48■■■■■ 36.1
PHF6Q8IWS0 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.962e-48■■■■■ 36.1
PHF6Q8IWS0 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 28.57□□□□□ -1.042e-48■■■■■ 36.1
PHF6Q8IWS0 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 35.9
PHF6Q8IWS0 IGF2BP3-213ENST00000491719 800 ntTSL 525.01■■□□□ 1.592e-6■■■■■ 35.9
PHF6Q8IWS0 IGF2BP3-210ENST00000476938 500 ntTSL 218.28■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 35.9
PHF6Q8IWS0 IGF2BP3-206ENST00000468005 2948 ntTSL 513.51□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 35.9
PHF6Q8IWS0 IGF2BP3-202ENST00000421467 2988 ntTSL 510.38□□□□□ -0.752e-6■■■■■ 35.9
PHF6Q8IWS0 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.372e-6■■■■■ 35.9
PHF6Q8IWS0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.759e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 EMC10-203ENST00000594508 859 nt25.89■■□□□ 1.749e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.619e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 EMC10-207ENST00000599293 1926 ntTSL 324.31■■□□□ 1.489e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 EMC10-208ENST00000601780 2178 ntTSL 1 (best)24.13■■□□□ 1.459e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 EIPR1-207ENST00000444776 594 ntTSL 421.19■□□□□ 0.989e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 320.99■□□□□ 0.959e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 520.99■□□□□ 0.959e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.849e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.789e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 518.98■□□□□ 0.639e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.379e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.149e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 515.69■□□□□ 0.19e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.079e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 510.58□□□□□ -0.729e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 39.58□□□□□ -0.889e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 EPN1-202ENST00000270460 16219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.989e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 EIPR1-IT1-201ENST00000454977 718 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.029e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 EPN1-206ENST00000589704 250 ntTSL 56.7□□□□□ -1.349e-10■■■■■ 35.7
PHF6Q8IWS0 ASMTL-AS1-204ENST00000443929 574 ntTSL 218.5■□□□□ 0.554e-7■■■■■ 35.5
PHF6Q8IWS0 KIAA0232-205ENST00000508423 700 ntTSL 223.62■■□□□ 1.371e-7■■■■■ 35.3
PHF6Q8IWS0 CCNY-209ENST00000493157 816 ntTSL 519.58■□□□□ 0.725e-7■■■■■ 35.3
PHF6Q8IWS0 CCNY-207ENST00000490012 793 ntTSL 319.15■□□□□ 0.665e-7■■■■■ 35.3
PHF6Q8IWS0 ACVR2B-203ENST00000465020 1666 ntTSL 217.52■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 35.3
PHF6Q8IWS0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 35.3
PHF6Q8IWS0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 35.3
PHF6Q8IWS0 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 35.3
PHF6Q8IWS0 CCNY-204ENST00000374706 3940 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.875e-7■■■■■ 35.3
PHF6Q8IWS0 CCNY-208ENST00000492478 809 ntTSL 59.39□□□□□ -0.915e-7■■■■■ 35.3
PHF6Q8IWS0 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 35.3
PHF6Q8IWS0 KIAA0232-204ENST00000503278 563 ntTSL 46.6□□□□□ -1.351e-7■■■■■ 35.3
PHF6Q8IWS0 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.411e-7■■■■■ 35.3
PHF6Q8IWS0 MAD1L1-212ENST00000450235 850 ntTSL 319.95■□□□□ 0.786e-8■■■■■ 35.2
PHF6Q8IWS0 MAD1L1-219ENST00000481633 548 ntTSL 215.82■□□□□ 0.126e-8■■■■■ 35.2
PHF6Q8IWS0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.086e-8■■■■■ 35.2
PHF6Q8IWS0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.026e-8■■■■■ 35.2
PHF6Q8IWS0 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.226e-8■■■■■ 35.2
PHF6Q8IWS0 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.396e-8■■■■■ 35.2
PHF6Q8IWS0 GET4-207ENST00000483469 370 ntTSL 220.66■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 35.2
PHF6Q8IWS0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 34.9
PHF6Q8IWS0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 34.3
PHF6Q8IWS0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 34.3
PHF6Q8IWS0 MRPS6-202ENST00000477091 1061 ntTSL 519.4■□□□□ 0.71e-10■■■■■ 34.3
PHF6Q8IWS0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.491e-10■■■■■ 34.3
PHF6Q8IWS0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.441e-10■■■■■ 34.3
PHF6Q8IWS0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 34.3
PHF6Q8IWS0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 34.3
PHF6Q8IWS0 MRPS6-205ENST00000488492 909 ntTSL 58.09□□□□□ -1.111e-10■■■■■ 34.3
PHF6Q8IWS0 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.881e-10■■■■■ 34.3
PHF6Q8IWS0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.156e-7■■■■■ 34.3
PHF6Q8IWS0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.76e-7■■■■■ 34.3
PHF6Q8IWS0 SDF4-205ENST00000465727 2095 ntTSL 218.78■□□□□ 0.66e-7■■■■■ 34.3
PHF6Q8IWS0 SDF4-203ENST00000403997 728 ntTSL 315.13■□□□□ 0.016e-7■■■■■ 34.3
PHF6Q8IWS0 CBFA2T3-207ENST00000564416 399 ntTSL 517.56■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 34.2
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