Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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