Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 MSB3YNL293W 1902 nt8.3□□□□□ -1.08
SEC39Q12745 YCR025CYCR025C 411 nt8.29□□□□□ -1.08
SEC39Q12745 DDI1YER143W 1287 nt8.29□□□□□ -1.08
SEC39Q12745 PUS7YOR243C 2031 nt8.27□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 MAM3YOL060C 2121 nt8.26□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.26□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 TMA23YMR269W 636 nt8.26□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 RRT8YOL048C 1029 nt8.26□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 Q0010Q0010 387 nt8.26□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 KGD2YDR148C 1392 nt8.25□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 MET13YGL125W 1803 nt8.25□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 SGF73YGL066W 1974 nt8.25□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 YER137CYER137C 447 nt8.25□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.25□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 FCP1YMR277W 2199 nt8.24□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 KRE1YNL322C 942 nt8.24□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 SPS100YHR139C 981 nt8.23□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 IPL1YPL209C 1104 nt8.23□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 snR31snR31 225 nt8.23□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 YBL111CYBL111C 2004 nt8.22□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 LYS20YDL182W 1287 nt8.22□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 BNA3YJL060W 1335 nt8.22□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 ADE2YOR128C 1716 nt8.21□□□□□ -1.09
SEC39Q12745 IMO32YGR031W 1029 nt8.21□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.2□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.2□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.2□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.2□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.2□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.2□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.2□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.2□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.2□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.2□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.2□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 RCR1YBR005W 642 nt8.19□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 CDC13YDL220C 2775 nt8.19□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 RPL2AYFR031C-A 765 nt8.18□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 YJR154WYJR154W 1041 nt8.18□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 BUD20YLR074C 501 nt8.18□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 APT1YML022W 564 nt8.18□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 YMR007WYMR007W 381 nt8.18□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 MET1YKR069W 1782 nt8.17□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 YNL140CYNL140C 570 nt8.17□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 AAC3YBR085W 924 nt8.17□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 TIF3YPR163C 1311 nt8.17□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.17□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.17□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.17□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 SWM1YDR260C 513 nt8.16□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 FLX1YIL134W 936 nt8.16□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 YLR030WYLR030W 792 nt8.16□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 RPL12BYDR418W 498 nt8.15□□□□□ -1.1
SEC39Q12745 YKR018CYKR018C 2178 nt8.15□□□□□ -1.11
SEC39Q12745 ADE8YDR408C 645 nt8.14□□□□□ -1.11
SEC39Q12745 FSH2YMR222C 672 nt8.14□□□□□ -1.11
SEC39Q12745 ABZ2YMR289W 1125 nt8.14□□□□□ -1.11
SEC39Q12745 SWT21YNL187W 1074 nt8.14□□□□□ -1.11
SEC39Q12745 THP3YPR045C 1413 nt8.13□□□□□ -1.11
SEC39Q12745 SBP1YHL034C 885 nt8.13□□□□□ -1.11
SEC39Q12745 MRN1YPL184C 1839 nt8.11□□□□□ -1.11
SEC39Q12745 NAS2YIL007C 663 nt8.11□□□□□ -1.11
SEC39Q12745 OPI3YJR073C 621 nt8.11□□□□□ -1.11
SEC39Q12745 CDD1YLR245C 429 nt8.11□□□□□ -1.11
SEC39Q12745 RSC9YML127W 1746 nt8.11□□□□□ -1.11
SEC39Q12745 PPS1YBR276C 2424 nt8.1□□□□□ -1.11
SEC39Q12745 SNU66YOR308C 1764 nt8.08□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 PRB1YEL060C 1908 nt8.08□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 TVP23YDR084C 600 nt8.08□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 YJL009WYJL009W 327 nt8.08□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 CYC3YAL039C 810 nt8.08□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 YKL053WYKL053W 375 nt8.08□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 HTS1YPR033C 1641 nt8.07□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.07□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt8.07□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 SER2YGR208W 930 nt8.07□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 SPE2YOL052C 1191 nt8.07□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 TRR1YDR353W 960 nt8.06□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 INM1YHR046C 888 nt8.06□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 YOR343CYOR343C 327 nt8.06□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 INO1YJL153C 1602 nt8.06□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 LRO1YNR008W 1986 nt8.04□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 TMS1YDR105C 1422 nt8.04□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 GLY1YEL046C 1164 nt8.04□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 MEP1YGR121C 1479 nt8.04□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 EDC3YEL015W 1656 nt8.04□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 YOR389WYOR389W 1875 nt8.03□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 TOD6YBL054W 1578 nt8.03□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 ADH3YMR083W 1128 nt8.03□□□□□ -1.12
SEC39Q12745 SAN1YDR143C 1833 nt8.02□□□□□ -1.13
SEC39Q12745 MAL31YBR298C 1845 nt8.02□□□□□ -1.13
SEC39Q12745 MOB1YIL106W 945 nt8.02□□□□□ -1.13
SEC39Q12745 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt8.02□□□□□ -1.13
SEC39Q12745 ENO2YHR174W 1314 nt8.02□□□□□ -1.13
SEC39Q12745 SEC24YIL109C 2781 nt8.01□□□□□ -1.13
SEC39Q12745 ICL2YPR006C 1728 nt8.01□□□□□ -1.13
SEC39Q12745 PHB2YGR231C 933 nt8.01□□□□□ -1.13
SEC39Q12745 RFS1YBR052C 633 nt8.01□□□□□ -1.13
SEC39Q12745 TGL5YOR081C 2250 nt8.01□□□□□ -1.13
SEC39Q12745 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8□□□□□ -1.13
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