Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 APT1YML022W 564 nt7.64□□□□□ -1.19
MSH5Q12175 YKR018CYKR018C 2178 nt7.64□□□□□ -1.19
MSH5Q12175 BUD31YCR063W 474 nt7.63□□□□□ -1.19
MSH5Q12175 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt7.63□□□□□ -1.19
MSH5Q12175 YDR306CYDR306C 1437 nt7.62□□□□□ -1.19
MSH5Q12175 KTR4YBR199W 1395 nt7.62□□□□□ -1.19
MSH5Q12175 GAS1YMR307W 1680 nt7.62□□□□□ -1.19
MSH5Q12175 YBR056WYBR056W 1506 nt7.62□□□□□ -1.19
MSH5Q12175 AMF1YOR378W 1548 nt7.61□□□□□ -1.19
MSH5Q12175 PRB1YEL060C 1908 nt7.6□□□□□ -1.19
MSH5Q12175 PTC6YCR079W 1329 nt7.59□□□□□ -1.19
MSH5Q12175 ENO2YHR174W 1314 nt7.59□□□□□ -1.19
MSH5Q12175 PMT1YDL095W 2454 nt7.59□□□□□ -1.19
MSH5Q12175 MAL31YBR298C 1845 nt7.59□□□□□ -1.19
MSH5Q12175 CDC13YDL220C 2775 nt7.59□□□□□ -1.2
MSH5Q12175 TDA4YJR116W 840 nt7.58□□□□□ -1.2
MSH5Q12175 SRP54YPR088C 1626 nt7.57□□□□□ -1.2
MSH5Q12175 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.57□□□□□ -1.2
MSH5Q12175 YJR149WYJR149W 1215 nt7.57□□□□□ -1.2
MSH5Q12175 SPS100YHR139C 981 nt7.56□□□□□ -1.2
MSH5Q12175 YMR226CYMR226C 804 nt7.56□□□□□ -1.2
MSH5Q12175 GLR1YPL091W 1452 nt7.55□□□□□ -1.2
MSH5Q12175 TOD6YBL054W 1578 nt7.54□□□□□ -1.2
MSH5Q12175 SEC24YIL109C 2781 nt7.54□□□□□ -1.2
MSH5Q12175 PPS1YBR276C 2424 nt7.54□□□□□ -1.2
MSH5Q12175 YEL023CYEL023C 2049 nt7.54□□□□□ -1.2
MSH5Q12175 GNA1YFL017C 480 nt7.53□□□□□ -1.2
MSH5Q12175 CKB1YGL019W 837 nt7.53□□□□□ -1.2
MSH5Q12175 SNZ1YMR096W 894 nt7.53□□□□□ -1.2
MSH5Q12175 ABZ2YMR289W 1125 nt7.53□□□□□ -1.2
MSH5Q12175 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.53□□□□□ -1.2
MSH5Q12175 PDC5YLR134W 1692 nt7.53□□□□□ -1.2
MSH5Q12175 AVL9YLR114C 2295 nt7.52□□□□□ -1.21
MSH5Q12175 YPI1YFR003C 468 nt7.52□□□□□ -1.21
MSH5Q12175 BUB2YMR055C 921 nt7.52□□□□□ -1.21
MSH5Q12175 MRP7YNL005C 1116 nt7.52□□□□□ -1.21
MSH5Q12175 RUP1YOR138C 2016 nt7.52□□□□□ -1.21
MSH5Q12175 YOR041CYOR041C 432 nt7.51□□□□□ -1.21
MSH5Q12175 RFS1YBR052C 633 nt7.51□□□□□ -1.21
MSH5Q12175 RMD8YFR048W 1989 nt7.51□□□□□ -1.21
MSH5Q12175 PEX28YHR150W 1740 nt7.5□□□□□ -1.21
MSH5Q12175 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.5□□□□□ -1.21
MSH5Q12175 YMR244WYMR244W 1068 nt7.5□□□□□ -1.21
MSH5Q12175 YPR126CYPR126C 309 nt7.5□□□□□ -1.21
MSH5Q12175 PUS7YOR243C 2031 nt7.5□□□□□ -1.21
MSH5Q12175 IML3YBR107C 738 nt7.49□□□□□ -1.21
MSH5Q12175 DIP5YPL265W 1827 nt7.49□□□□□ -1.21
MSH5Q12175 TRR1YDR353W 960 nt7.48□□□□□ -1.21
MSH5Q12175 TPC1YGR096W 945 nt7.47□□□□□ -1.21
MSH5Q12175 YIR035CYIR035C 765 nt7.47□□□□□ -1.21
MSH5Q12175 TPO1YLL028W 1761 nt7.46□□□□□ -1.21
MSH5Q12175 LEU2YCL018W 1095 nt7.46□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 EDC3YEL015W 1656 nt7.46□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 CTI6YPL181W 1521 nt7.46□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 YOR389WYOR389W 1875 nt7.45□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 NAM8YHR086W 1572 nt7.45□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 STF1YDL130W-A 261 nt7.44□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 SNA3YJL151C 402 nt7.44□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 YNR029CYNR029C 1290 nt7.44□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 CDC23YHR166C 1881 nt7.44□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 ICL2YPR006C 1728 nt7.44□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 PPZ2YDR436W 2133 nt7.43□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 SRF1YDL133W 1314 nt7.43□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 GUT1YHL032C 2130 nt7.43□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 YBL113CYBL113C 2379 nt7.42□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 ARO3YDR035W 1113 nt7.42□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 TES1YJR019C 1050 nt7.42□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 YPT11YNL304W 1254 nt7.42□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 SSC1YJR045C 1965 nt7.41□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 GTS1YGL181W 1191 nt7.41□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 HRA1HRA1 564 nt7.41□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 REX2YLR059C 810 nt7.41□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 ELP6YMR312W 822 nt7.41□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 EHT1YBR177C 1356 nt7.41□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 DCR2YLR361C 1737 nt7.41□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 YGR137WYGR137W 375 nt7.4□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 RCF2YNR018W 675 nt7.4□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 ALG7YBR243C 1347 nt7.4□□□□□ -1.22
MSH5Q12175 WSC3YOL105C 1671 nt7.4□□□□□ -1.23
MSH5Q12175 CDA1YLR307W 906 nt7.39□□□□□ -1.23
MSH5Q12175 CAN1YEL063C 1773 nt7.38□□□□□ -1.23
MSH5Q12175 MTC6YHR151C 1581 nt7.38□□□□□ -1.23
MSH5Q12175 CCT5YJR064W 1689 nt7.38□□□□□ -1.23
MSH5Q12175 YJL045WYJL045W 1905 nt7.37□□□□□ -1.23
MSH5Q12175 ADH6YMR318C 1083 nt7.37□□□□□ -1.23
MSH5Q12175 LEO1YOR123C 1395 nt7.36□□□□□ -1.23
MSH5Q12175 FLC2YAL053W 2352 nt7.35□□□□□ -1.23
MSH5Q12175 AGP2YBR132C 1791 nt7.34□□□□□ -1.23
MSH5Q12175 MEU1YLR017W 1014 nt7.34□□□□□ -1.23
MSH5Q12175 RCF1YML030W 480 nt7.34□□□□□ -1.23
MSH5Q12175 ADH1YOL086C 1047 nt7.34□□□□□ -1.23
MSH5Q12175 YJL043WYJL043W 774 nt7.33□□□□□ -1.24
MSH5Q12175 ENB1YOL158C 1821 nt7.32□□□□□ -1.24
MSH5Q12175 RQC1YDR333C 2172 nt7.3□□□□□ -1.24
MSH5Q12175 MHF1YOL086W-A 273 nt7.3□□□□□ -1.24
MSH5Q12175 RSM7YJR113C 744 nt7.29□□□□□ -1.24
MSH5Q12175 TCB1YOR086C 3561 nt7.29□□□□□ -1.24
MSH5Q12175 HHY1YEL059W 309 nt7.28□□□□□ -1.24
MSH5Q12175 SNF4YGL115W 969 nt7.28□□□□□ -1.24
MSH5Q12175 RBG2YGR173W 1107 nt7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.9 ms