Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 TGL5YOR081C 2250 nt7.44□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 GNP1YDR508C 1992 nt7.44□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 LRO1YNR008W 1986 nt7.44□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 WSC4YHL028W 1818 nt7.43□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 PRC1YMR297W 1599 nt7.43□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.43□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 STP3YLR375W 1032 nt7.43□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 KRE1YNL322C 942 nt7.42□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 DIP5YPL265W 1827 nt7.41□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.4□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 RSM7YJR113C 744 nt7.4□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 TDA4YJR116W 840 nt7.4□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 YPL264CYPL264C 1062 nt7.4□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 YBR232CYBR232C 360 nt7.4□□□□□ -1.22
NUP49Q02199 BEM1YBR200W 1656 nt7.39□□□□□ -1.23
NUP49Q02199 VBA3YCL069W 1377 nt7.38□□□□□ -1.23
NUP49Q02199 IGD1YFR017C 588 nt7.38□□□□□ -1.23
NUP49Q02199 YLR173WYLR173W 1827 nt7.38□□□□□ -1.23
NUP49Q02199 HXT9YJL219W 1704 nt7.38□□□□□ -1.23
NUP49Q02199 SDS24YBR214W 1584 nt7.37□□□□□ -1.23
NUP49Q02199 SGF73YGL066W 1974 nt7.37□□□□□ -1.23
NUP49Q02199 YKR012CYKR012C 378 nt7.37□□□□□ -1.23
NUP49Q02199 KTR4YBR199W 1395 nt7.36□□□□□ -1.23
NUP49Q02199 CHA1YCL064C 1083 nt7.36□□□□□ -1.23
NUP49Q02199 RRT6YGL146C 936 nt7.36□□□□□ -1.23
NUP49Q02199 SPE4YLR146C 903 nt7.36□□□□□ -1.23
NUP49Q02199 EHT1YBR177C 1356 nt7.35□□□□□ -1.23
NUP49Q02199 YER152CYER152C 1332 nt7.35□□□□□ -1.23
NUP49Q02199 PHB2YGR231C 933 nt7.35□□□□□ -1.23
NUP49Q02199 TOP3YLR234W 1971 nt7.34□□□□□ -1.23
NUP49Q02199 ADH3YMR083W 1128 nt7.34□□□□□ -1.23
NUP49Q02199 PMT1YDL095W 2454 nt7.33□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 YFR020WYFR020W 699 nt7.32□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 MRP7YNL005C 1116 nt7.32□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 ATP10YLR393W 840 nt7.31□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 ALG7YBR243C 1347 nt7.3□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 ARO3YDR035W 1113 nt7.3□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 RCF1YML030W 480 nt7.3□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 WSC3YOL105C 1671 nt7.3□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 RSC9YML127W 1746 nt7.3□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 ERG6YML008C 1152 nt7.29□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 RNA170RNA170 169 nt7.29□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 FLX1YIL134W 936 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 YDR306CYDR306C 1437 nt7.27□□□□□ -1.24
NUP49Q02199 RTG2YGL252C 1767 nt7.27□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 ENO1YGR254W 1314 nt7.27□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 ERR3YMR323W 1314 nt7.27□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 ERR1YOR393W 1314 nt7.27□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 ERR2YPL281C 1314 nt7.27□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 TPO1YLL028W 1761 nt7.26□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 PDC5YLR134W 1692 nt7.26□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 MOB1YIL106W 945 nt7.26□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 YLR460CYLR460C 1131 nt7.26□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 IPL1YPL209C 1104 nt7.26□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 CKB1YGL019W 837 nt7.25□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 YGR137WYGR137W 375 nt7.25□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 YMR253CYMR253C 1245 nt7.25□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 ELP6YMR312W 822 nt7.25□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 YLR030WYLR030W 792 nt7.24□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 SEN2YLR105C 1134 nt7.24□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 PEX28YHR150W 1740 nt7.24□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 AVL9YLR114C 2295 nt7.24□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 CHS7YHR142W 951 nt7.23□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 MET22YOL064C 1074 nt7.23□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 RUP1YOR138C 2016 nt7.23□□□□□ -1.25
NUP49Q02199 GGC1YDL198C 903 nt7.21□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 YJL064WYJL064W 396 nt7.21□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 CYC3YAL039C 810 nt7.21□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 SRP102YKL154W 735 nt7.21□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 CDA1YLR307W 906 nt7.21□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 OLA1YBR025C 1185 nt7.21□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 FRT1YOR324C 1809 nt7.21□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 MTC6YHR151C 1581 nt7.2□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 TES1YJR019C 1050 nt7.2□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 PMA2YPL036W 2844 nt7.2□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 PDC6YGR087C 1692 nt7.19□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 SAM50YNL026W 1455 nt7.19□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 SNU66YOR308C 1764 nt7.19□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 PAU19YMR325W 375 nt7.19□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 YCR025CYCR025C 411 nt7.18□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 HXT8YJL214W 1710 nt7.18□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 AQR1YNL065W 1761 nt7.18□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 GCD11YER025W 1584 nt7.17□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 PUP3YER094C 618 nt7.17□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 SNP1YIL061C 903 nt7.17□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 SNA3YJL151C 402 nt7.17□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 YLR280CYLR280C 351 nt7.17□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 POB3YML069W 1659 nt7.16□□□□□ -1.26
NUP49Q02199 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.16□□□□□ -1.26
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