Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 GAL2YLR081W 1725 nt8.74□□□□□ -1.01
SHQ1P40486 MDL2YPL270W 2322 nt8.74□□□□□ -1.01
SHQ1P40486 DUS3YLR401C 2007 nt8.72□□□□□ -1.01
SHQ1P40486 BUB2YMR055C 921 nt8.72□□□□□ -1.01
SHQ1P40486 YIR035CYIR035C 765 nt8.7□□□□□ -1.02
SHQ1P40486 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.69□□□□□ -1.02
SHQ1P40486 YLR280CYLR280C 351 nt8.69□□□□□ -1.02
SHQ1P40486 ERO1YML130C 1692 nt8.68□□□□□ -1.02
SHQ1P40486 YGR210CYGR210C 1236 nt8.66□□□□□ -1.02
SHQ1P40486 TOK1YJL093C 2076 nt8.66□□□□□ -1.02
SHQ1P40486 INO1YJL153C 1602 nt8.65□□□□□ -1.02
SHQ1P40486 RNA170RNA170 169 nt8.65□□□□□ -1.02
SHQ1P40486 DIA4YHR011W 1341 nt8.64□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 BUD31YCR063W 474 nt8.63□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 MRN1YPL184C 1839 nt8.63□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 ADE16YLR028C 1776 nt8.63□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 FCY1YPR062W 477 nt8.62□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 LRO1YNR008W 1986 nt8.61□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.61□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.61□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.61□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.61□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.61□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 YLR460CYLR460C 1131 nt8.61□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 MET22YOL064C 1074 nt8.61□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 NDE2YDL085W 1638 nt8.61□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 FIT1YDR534C 1587 nt8.61□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 DIP5YPL265W 1827 nt8.6□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 BUD20YLR074C 501 nt8.6□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 HEM14YER014W 1620 nt8.6□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 EHT1YBR177C 1356 nt8.6□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 TIF3YPR163C 1311 nt8.59□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 GLY1YEL046C 1164 nt8.59□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 YNL140CYNL140C 570 nt8.59□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 YPL108WYPL108W 507 nt8.59□□□□□ -1.03
SHQ1P40486 CHS7YHR142W 951 nt8.57□□□□□ -1.04
SHQ1P40486 TGL5YOR081C 2250 nt8.56□□□□□ -1.04
SHQ1P40486 UFD1YGR048W 1086 nt8.56□□□□□ -1.04
SHQ1P40486 OLA1YBR025C 1185 nt8.56□□□□□ -1.04
SHQ1P40486 INM1YHR046C 888 nt8.55□□□□□ -1.04
SHQ1P40486 PDC6YGR087C 1692 nt8.55□□□□□ -1.04
SHQ1P40486 OCH1YGL038C 1443 nt8.54□□□□□ -1.04
SHQ1P40486 MDH2YOL126C 1134 nt8.54□□□□□ -1.04
SHQ1P40486 WSC4YHL028W 1818 nt8.54□□□□□ -1.04
SHQ1P40486 HSV2YGR223C 1347 nt8.54□□□□□ -1.04
SHQ1P40486 TDA4YJR116W 840 nt8.53□□□□□ -1.04
SHQ1P40486 YOR343CYOR343C 327 nt8.53□□□□□ -1.04
SHQ1P40486 PFS2YNL317W 1398 nt8.52□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 HRA1HRA1 564 nt8.52□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 SHC1YER096W 1539 nt8.52□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 ARO3YDR035W 1113 nt8.51□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 YMR166CYMR166C 1107 nt8.51□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 RHO1YPR165W 630 nt8.51□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 ALG7YBR243C 1347 nt8.51□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 GRH1YDR517W 1119 nt8.5□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 CAK1YFL029C 1107 nt8.5□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 YJL160CYJL160C 864 nt8.5□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 RCF1YML030W 480 nt8.5□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 MRP7YNL005C 1116 nt8.5□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 PAU21YOR394W 495 nt8.5□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 PAU22YPL282C 495 nt8.5□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 LSP1YPL004C 1026 nt8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 PMT7YDR307W 1989 nt8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 MCM5YLR274W 2328 nt8.49□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 RPL12BYDR418W 498 nt8.48□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 HXT8YJL214W 1710 nt8.48□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 THI73YLR004C 1572 nt8.48□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 PUP3YER094C 618 nt8.47□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 KTR4YBR199W 1395 nt8.47□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 WSC3YOL105C 1671 nt8.46□□□□□ -1.05
SHQ1P40486 MET13YGL125W 1803 nt8.46□□□□□ -1.06
SHQ1P40486 RRT14YIL127C 621 nt8.46□□□□□ -1.06
SHQ1P40486 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8.46□□□□□ -1.06
SHQ1P40486 MRP1YDR347W 966 nt8.45□□□□□ -1.06
SHQ1P40486 RPL2AYFR031C-A 765 nt8.44□□□□□ -1.06
SHQ1P40486 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt8.44□□□□□ -1.06
SHQ1P40486 ELP6YMR312W 822 nt8.44□□□□□ -1.06
SHQ1P40486 MFT1YML062C 1179 nt8.43□□□□□ -1.06
SHQ1P40486 MTC6YHR151C 1581 nt8.42□□□□□ -1.06
SHQ1P40486 RSC4YKR008W 1878 nt8.42□□□□□ -1.06
SHQ1P40486 SLM3YDL033C 1254 nt8.41□□□□□ -1.06
SHQ1P40486 YGR137WYGR137W 375 nt8.41□□□□□ -1.06
SHQ1P40486 TPO1YLL028W 1761 nt8.4□□□□□ -1.06
SHQ1P40486 PMT1YDL095W 2454 nt8.4□□□□□ -1.06
SHQ1P40486 SNP1YIL061C 903 nt8.4□□□□□ -1.06
SHQ1P40486 PET18YCR020C 648 nt8.39□□□□□ -1.07
SHQ1P40486 YIL177CYIL177C 5277 nt8.38□□□□□ -1.07
SHQ1P40486 GDH1YOR375C 1365 nt8.38□□□□□ -1.07
SHQ1P40486 MAS1YLR163C 1389 nt8.37□□□□□ -1.07
SHQ1P40486 YPR084WYPR084W 1371 nt8.37□□□□□ -1.07
SHQ1P40486 YPT31YER031C 672 nt8.37□□□□□ -1.07
SHQ1P40486 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt8.36□□□□□ -1.07
SHQ1P40486 YER156CYER156C 1017 nt8.36□□□□□ -1.07
SHQ1P40486 FRA1YLL029W 2250 nt8.36□□□□□ -1.07
SHQ1P40486 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.35□□□□□ -1.07
SHQ1P40486 BXI1YNL305C 894 nt8.35□□□□□ -1.07
SHQ1P40486 SGF73YGL066W 1974 nt8.35□□□□□ -1.07
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