Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 ERR1YOR393W 1314 nt7.47□□□□□ -1.21
DDI1P40087 ERR2YPL281C 1314 nt7.47□□□□□ -1.21
DDI1P40087 MAS2YHR024C 1449 nt7.46□□□□□ -1.21
DDI1P40087 TGL5YOR081C 2250 nt7.45□□□□□ -1.22
DDI1P40087 GLY1YEL046C 1164 nt7.45□□□□□ -1.22
DDI1P40087 WSC4YHL028W 1818 nt7.45□□□□□ -1.22
DDI1P40087 YNL040WYNL040W 1371 nt7.45□□□□□ -1.22
DDI1P40087 YDR306CYDR306C 1437 nt7.44□□□□□ -1.22
DDI1P40087 MRN1YPL184C 1839 nt7.44□□□□□ -1.22
DDI1P40087 BUD31YCR063W 474 nt7.44□□□□□ -1.22
DDI1P40087 RRT6YGL146C 936 nt7.44□□□□□ -1.22
DDI1P40087 HXT13YEL069C 1695 nt7.44□□□□□ -1.22
DDI1P40087 SNU66YOR308C 1764 nt7.43□□□□□ -1.22
DDI1P40087 POT1YIL160C 1254 nt7.43□□□□□ -1.22
DDI1P40087 YJL195CYJL195C 702 nt7.43□□□□□ -1.22
DDI1P40087 TAF13YML098W 504 nt7.43□□□□□ -1.22
DDI1P40087 MSB3YNL293W 1902 nt7.42□□□□□ -1.22
DDI1P40087 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.42□□□□□ -1.22
DDI1P40087 RSM7YJR113C 744 nt7.42□□□□□ -1.22
DDI1P40087 TDA4YJR116W 840 nt7.42□□□□□ -1.22
DDI1P40087 KRE1YNL322C 942 nt7.42□□□□□ -1.22
DDI1P40087 SPE2YOL052C 1191 nt7.42□□□□□ -1.22
DDI1P40087 YER152CYER152C 1332 nt7.41□□□□□ -1.22
DDI1P40087 HXT9YJL219W 1704 nt7.41□□□□□ -1.22
DDI1P40087 AQR1YNL065W 1761 nt7.41□□□□□ -1.22
DDI1P40087 STE4YOR212W 1272 nt7.4□□□□□ -1.22
DDI1P40087 KTR4YBR199W 1395 nt7.4□□□□□ -1.22
DDI1P40087 LRO1YNR008W 1986 nt7.39□□□□□ -1.23
DDI1P40087 MET13YGL125W 1803 nt7.38□□□□□ -1.23
DDI1P40087 FUN14YAL008W 597 nt7.38□□□□□ -1.23
DDI1P40087 YKR012CYKR012C 378 nt7.37□□□□□ -1.23
DDI1P40087 MRP7YNL005C 1116 nt7.37□□□□□ -1.23
DDI1P40087 SAM50YNL026W 1455 nt7.36□□□□□ -1.23
DDI1P40087 RSC9YML127W 1746 nt7.36□□□□□ -1.23
DDI1P40087 CDC13YDL220C 2775 nt7.36□□□□□ -1.23
DDI1P40087 YGR137WYGR137W 375 nt7.36□□□□□ -1.23
DDI1P40087 SGF73YGL066W 1974 nt7.36□□□□□ -1.23
DDI1P40087 ADH7YCR105W 1086 nt7.35□□□□□ -1.23
DDI1P40087 PAU15YIR041W 375 nt7.34□□□□□ -1.23
DDI1P40087 GNP1YDR508C 1992 nt7.33□□□□□ -1.24
DDI1P40087 FCP1YMR277W 2199 nt7.33□□□□□ -1.24
DDI1P40087 POB3YML069W 1659 nt7.32□□□□□ -1.24
DDI1P40087 FSH2YMR222C 672 nt7.32□□□□□ -1.24
DDI1P40087 EHT1YBR177C 1356 nt7.32□□□□□ -1.24
DDI1P40087 DIP5YPL265W 1827 nt7.31□□□□□ -1.24
DDI1P40087 WSC3YOL105C 1671 nt7.31□□□□□ -1.24
DDI1P40087 YLR460CYLR460C 1131 nt7.3□□□□□ -1.24
DDI1P40087 THP3YPR045C 1413 nt7.29□□□□□ -1.24
DDI1P40087 YEL008WYEL008W 381 nt7.29□□□□□ -1.24
DDI1P40087 RCF1YML030W 480 nt7.29□□□□□ -1.24
DDI1P40087 SDS24YBR214W 1584 nt7.29□□□□□ -1.24
DDI1P40087 YBL111CYBL111C 2004 nt7.28□□□□□ -1.24
DDI1P40087 PUS7YOR243C 2031 nt7.28□□□□□ -1.24
DDI1P40087 RAD51YER095W 1203 nt7.28□□□□□ -1.24
DDI1P40087 CKB1YGL019W 837 nt7.28□□□□□ -1.24
DDI1P40087 VBA3YCL069W 1377 nt7.28□□□□□ -1.24
DDI1P40087 NIF3YGL221C 867 nt7.27□□□□□ -1.25
DDI1P40087 YLR349WYLR349W 507 nt7.27□□□□□ -1.25
DDI1P40087 GSF2YML048W 1212 nt7.27□□□□□ -1.25
DDI1P40087 OLA1YBR025C 1185 nt7.27□□□□□ -1.25
DDI1P40087 AVL9YLR114C 2295 nt7.26□□□□□ -1.25
DDI1P40087 ARO3YDR035W 1113 nt7.26□□□□□ -1.25
DDI1P40087 CPD1YGR247W 720 nt7.26□□□□□ -1.25
DDI1P40087 YLR030WYLR030W 792 nt7.26□□□□□ -1.25
DDI1P40087 TUB4YLR212C 1422 nt7.26□□□□□ -1.25
DDI1P40087 YFR020WYFR020W 699 nt7.24□□□□□ -1.25
DDI1P40087 CHS7YHR142W 951 nt7.24□□□□□ -1.25
DDI1P40087 TES1YJR019C 1050 nt7.24□□□□□ -1.25
DDI1P40087 ENO1YGR254W 1314 nt7.24□□□□□ -1.25
DDI1P40087 ALG7YBR243C 1347 nt7.24□□□□□ -1.25
DDI1P40087 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.23□□□□□ -1.25
DDI1P40087 APS2YJR058C 444 nt7.23□□□□□ -1.25
DDI1P40087 PMT1YDL095W 2454 nt7.23□□□□□ -1.25
DDI1P40087 NAS2YIL007C 663 nt7.22□□□□□ -1.25
DDI1P40087 MTC6YHR151C 1581 nt7.21□□□□□ -1.25
DDI1P40087 MAL31YBR298C 1845 nt7.2□□□□□ -1.26
DDI1P40087 CDA1YLR307W 906 nt7.2□□□□□ -1.26
DDI1P40087 ELP6YMR312W 822 nt7.2□□□□□ -1.26
DDI1P40087 PEX28YHR150W 1740 nt7.2□□□□□ -1.26
DDI1P40087 YER137CYER137C 447 nt7.19□□□□□ -1.26
DDI1P40087 GNA1YFL017C 480 nt7.19□□□□□ -1.26
DDI1P40087 SNP1YIL061C 903 nt7.19□□□□□ -1.26
DDI1P40087 ADH6YMR318C 1083 nt7.19□□□□□ -1.26
DDI1P40087 PDC5YLR134W 1692 nt7.18□□□□□ -1.26
DDI1P40087 RUP1YOR138C 2016 nt7.18□□□□□ -1.26
DDI1P40087 TPO1YLL028W 1761 nt7.18□□□□□ -1.26
DDI1P40087 RPL12BYDR418W 498 nt7.17□□□□□ -1.26
DDI1P40087 MOB1YIL106W 945 nt7.17□□□□□ -1.26
DDI1P40087 RNA170RNA170 169 nt7.17□□□□□ -1.26
DDI1P40087 MET22YOL064C 1074 nt7.17□□□□□ -1.26
DDI1P40087 BNA3YJL060W 1335 nt7.17□□□□□ -1.26
DDI1P40087 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.16□□□□□ -1.26
DDI1P40087 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.16□□□□□ -1.26
DDI1P40087 ADH3YMR083W 1128 nt7.16□□□□□ -1.26
DDI1P40087 APT1YML022W 564 nt7.15□□□□□ -1.26
DDI1P40087 YOR041CYOR041C 432 nt7.15□□□□□ -1.26
DDI1P40087 RHO1YPR165W 630 nt7.15□□□□□ -1.26
DDI1P40087 YEL023CYEL023C 2049 nt7.15□□□□□ -1.27
DDI1P40087 EDC3YEL015W 1656 nt7.14□□□□□ -1.27
DDI1P40087 PHB2YGR231C 933 nt7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms