Protein–RNA interactions for Protein: O75879

GATB, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATBO75879 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATBO75879 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATBO75879 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATBO75879 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATBO75879 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATBO75879 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATBO75879 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATBO75879 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATBO75879 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATBO75879 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATBO75879 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATBO75879 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATBO75879 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATBO75879 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATBO75879 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATBO75879 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATBO75879 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATBO75879 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATBO75879 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATBO75879 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATBO75879 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATBO75879 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATBO75879 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATBO75879 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATBO75879 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATBO75879 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATBO75879 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATBO75879 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATBO75879 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATBO75879 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATBO75879 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATBO75879 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATBO75879 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATBO75879 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATBO75879 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATBO75879 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATBO75879 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATBO75879 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATBO75879 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GATBO75879 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATBO75879 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GATBO75879 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATBO75879 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATBO75879 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATBO75879 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GATBO75879 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATBO75879 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATBO75879 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATBO75879 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATBO75879 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATBO75879 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATBO75879 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATBO75879 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATBO75879 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATBO75879 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATBO75879 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATBO75879 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATBO75879 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATBO75879 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATBO75879 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATBO75879 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATBO75879 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GATBO75879 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GATBO75879 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATBO75879 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GATBO75879 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATBO75879 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATBO75879 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATBO75879 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATBO75879 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATBO75879 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATBO75879 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATBO75879 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATBO75879 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATBO75879 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATBO75879 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATBO75879 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATBO75879 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATBO75879 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATBO75879 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GATBO75879 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATBO75879 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATBO75879 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATBO75879 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATBO75879 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATBO75879 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATBO75879 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATBO75879 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATBO75879 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATBO75879 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GATBO75879 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATBO75879 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATBO75879 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATBO75879 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATBO75879 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GATBO75879 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATBO75879 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATBO75879 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATBO75879 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATBO75879 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms