Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
F8VP50 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
F8VP50 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
F8VP50 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
F8VP50 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
F8VP50 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
F8VP50 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
F8VP50 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
F8VP50 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
F8VP50 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
F8VP50 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
F8VP50 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
F8VP50 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
F8VP50 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
F8VP50 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
F8VP50 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
F8VP50 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
F8VP50 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
F8VP50 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
F8VP50 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
F8VP50 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
F8VP50 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
F8VP50 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
F8VP50 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
F8VP50 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
F8VP50 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
F8VP50 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
F8VP50 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
F8VP50 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
F8VP50 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
F8VP50 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
F8VP50 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
F8VP50 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
F8VP50 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
F8VP50 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
F8VP50 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
F8VP50 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
F8VP50 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
F8VP50 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
F8VP50 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
F8VP50 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
F8VP50 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
F8VP50 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
F8VP50 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
F8VP50 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
F8VP50 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
F8VP50 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
F8VP50 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
F8VP50 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
F8VP50 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
F8VP50 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
F8VP50 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
F8VP50 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
F8VP50 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
F8VP50 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
F8VP50 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
F8VP50 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
F8VP50 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
F8VP50 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
F8VP50 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
F8VP50 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
F8VP50 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
F8VP50 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
F8VP50 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
F8VP50 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
F8VP50 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
F8VP50 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
F8VP50 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
F8VP50 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
F8VP50 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
F8VP50 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
F8VP50 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
F8VP50 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
F8VP50 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
F8VP50 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
F8VP50 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
F8VP50 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
F8VP50 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
F8VP50 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
F8VP50 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
F8VP50 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
F8VP50 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
F8VP50 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
F8VP50 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
F8VP50 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
F8VP50 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
F8VP50 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
F8VP50 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
F8VP50 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
F8VP50 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
F8VP50 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
F8VP50 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
F8VP50 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
F8VP50 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
F8VP50 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
F8VP50 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
F8VP50 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
F8VP50 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
F8VP50 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
F8VP50 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms