Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC82Q8N4S0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms