Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms