Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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EXT1Q16394 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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EXT1Q16394 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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EXT1Q16394 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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EXT1Q16394 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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EXT1Q16394 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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EXT1Q16394 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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EXT1Q16394 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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EXT1Q16394 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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