Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD21O60216 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RAD21O60216 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RAD21O60216 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD21O60216 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD21O60216 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD21O60216 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD21O60216 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD21O60216 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD21O60216 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD21O60216 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD21O60216 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD21O60216 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD21O60216 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD21O60216 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD21O60216 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD21O60216 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD21O60216 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD21O60216 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD21O60216 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD21O60216 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD21O60216 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD21O60216 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD21O60216 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD21O60216 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD21O60216 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD21O60216 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD21O60216 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD21O60216 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD21O60216 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD21O60216 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD21O60216 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD21O60216 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD21O60216 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD21O60216 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD21O60216 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD21O60216 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD21O60216 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD21O60216 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD21O60216 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD21O60216 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD21O60216 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD21O60216 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD21O60216 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD21O60216 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD21O60216 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD21O60216 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD21O60216 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD21O60216 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD21O60216 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD21O60216 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD21O60216 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD21O60216 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD21O60216 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD21O60216 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD21O60216 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD21O60216 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD21O60216 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD21O60216 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD21O60216 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms