Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNE4Q8N205 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNE4Q8N205 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNE4Q8N205 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNE4Q8N205 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNE4Q8N205 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNE4Q8N205 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNE4Q8N205 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNE4Q8N205 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNE4Q8N205 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNE4Q8N205 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNE4Q8N205 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNE4Q8N205 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNE4Q8N205 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 302.5 ms