Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3C1V9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3C1V9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3C1V9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3C1V9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3C1V9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3C1V9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3C1V9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3C1V9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3C1V9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3C1V9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3C1V9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3C1V9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3C1V9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3C1V9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3C1V9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3C1V9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3C1V9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3C1V9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3C1V9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3C1V9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3C1V9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3C1V9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3C1V9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3C1V9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3C1V9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Q3C1V9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Q3C1V9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3C1V9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3C1V9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3C1V9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3C1V9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3C1V9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3C1V9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3C1V9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3C1V9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3C1V9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3C1V9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3C1V9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3C1V9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3C1V9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3C1V9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3C1V9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3C1V9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3C1V9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3C1V9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3C1V9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3C1V9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3C1V9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms