Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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HIF1AQ16665 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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HIF1AQ16665 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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HIF1AQ16665 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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HIF1AQ16665 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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