Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EEA1Q15075 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
EEA1Q15075 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EEA1Q15075 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EEA1Q15075 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EEA1Q15075 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
EEA1Q15075 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EEA1Q15075 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
EEA1Q15075 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
EEA1Q15075 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
EEA1Q15075 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
EEA1Q15075 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
EEA1Q15075 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
EEA1Q15075 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EEA1Q15075 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EEA1Q15075 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EEA1Q15075 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EEA1Q15075 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
EEA1Q15075 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
EEA1Q15075 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
EEA1Q15075 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
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