Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRIP3Q6Q6R5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms