Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms