Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms