Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL2P13500 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL2P13500 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL2P13500 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL2P13500 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL2P13500 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL2P13500 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL2P13500 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL2P13500 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL2P13500 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL2P13500 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL2P13500 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL2P13500 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL2P13500 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL2P13500 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL2P13500 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL2P13500 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL2P13500 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL2P13500 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL2P13500 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL2P13500 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL2P13500 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL2P13500 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL2P13500 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL2P13500 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL2P13500 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL2P13500 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL2P13500 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL2P13500 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL2P13500 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL2P13500 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL2P13500 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL2P13500 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL2P13500 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL2P13500 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL2P13500 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL2P13500 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL2P13500 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL2P13500 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL2P13500 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL2P13500 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL2P13500 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL2P13500 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL2P13500 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL2P13500 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL2P13500 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms