Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFLP07196 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFLP07196 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFLP07196 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFLP07196 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFLP07196 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFLP07196 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFLP07196 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFLP07196 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFLP07196 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFLP07196 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFLP07196 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFLP07196 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFLP07196 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFLP07196 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFLP07196 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFLP07196 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFLP07196 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFLP07196 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFLP07196 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFLP07196 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFLP07196 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFLP07196 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFLP07196 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFLP07196 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFLP07196 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFLP07196 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFLP07196 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFLP07196 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFLP07196 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFLP07196 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFLP07196 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFLP07196 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFLP07196 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFLP07196 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFLP07196 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFLP07196 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEFLP07196 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFLP07196 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFLP07196 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms