Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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