Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFLP07196 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NEFLP07196 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFLP07196 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFLP07196 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFLP07196 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFLP07196 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFLP07196 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFLP07196 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFLP07196 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFLP07196 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFLP07196 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFLP07196 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFLP07196 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFLP07196 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFLP07196 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFLP07196 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFLP07196 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFLP07196 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFLP07196 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFLP07196 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFLP07196 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFLP07196 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFLP07196 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFLP07196 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFLP07196 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFLP07196 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFLP07196 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFLP07196 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFLP07196 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFLP07196 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFLP07196 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFLP07196 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFLP07196 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms