Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARFGEF2Q9Y6D5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGEF2Q9Y6D5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms