Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
TNIKQ9UKE5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms