Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms