Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LAD1O00515 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAD1O00515 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAD1O00515 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAD1O00515 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAD1O00515 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAD1O00515 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAD1O00515 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAD1O00515 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAD1O00515 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAD1O00515 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAD1O00515 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAD1O00515 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAD1O00515 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAD1O00515 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAD1O00515 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAD1O00515 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAD1O00515 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAD1O00515 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAD1O00515 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAD1O00515 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAD1O00515 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAD1O00515 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAD1O00515 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAD1O00515 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAD1O00515 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAD1O00515 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAD1O00515 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAD1O00515 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAD1O00515 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAD1O00515 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAD1O00515 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAD1O00515 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAD1O00515 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAD1O00515 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAD1O00515 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 304.8 ms