Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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