Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.4 ms