Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFLP07196 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFLP07196 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFLP07196 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFLP07196 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFLP07196 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFLP07196 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFLP07196 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFLP07196 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFLP07196 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFLP07196 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFLP07196 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFLP07196 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFLP07196 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFLP07196 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFLP07196 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFLP07196 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFLP07196 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFLP07196 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFLP07196 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFLP07196 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFLP07196 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFLP07196 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFLP07196 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFLP07196 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFLP07196 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFLP07196 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFLP07196 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFLP07196 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFLP07196 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFLP07196 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFLP07196 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFLP07196 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFLP07196 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFLP07196 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFLP07196 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFLP07196 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFLP07196 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFLP07196 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFLP07196 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFLP07196 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFLP07196 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFLP07196 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFLP07196 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFLP07196 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFLP07196 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEFLP07196 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFLP07196 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFLP07196 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFLP07196 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFLP07196 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFLP07196 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFLP07196 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFLP07196 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFLP07196 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFLP07196 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFLP07196 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFLP07196 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFLP07196 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFLP07196 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFLP07196 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFLP07196 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEFLP07196 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEFLP07196 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEFLP07196 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEFLP07196 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEFLP07196 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEFLP07196 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEFLP07196 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEFLP07196 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEFLP07196 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEFLP07196 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEFLP07196 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEFLP07196 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEFLP07196 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEFLP07196 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEFLP07196 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms