Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE2O96020 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms