Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMCO3A2RU48 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms