Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXD3Q9UJU5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms